中国科学院植物研究所植物园
于1955年建成。是我国和科学院植物学与植物园领域对外展示成果和学术交流的窗口和门户。
中国科学院武汉植物园
中国科学院武汉植物园始建于1956年。已成为我国在区域植物资源研究方面独具特色、在国内外有较高声誉的植物学研究机构。
中国科学院华南植物园
创建于1956年，华拥有广东鹤山森林生态系统国家野外科学观测研究站和小良热带海岸带退化生态系统恢复与重建定位研究站等一批野外生态观测研究站点。
中国科学院昆明植物研究所植物园
创建于1938年，是一个以引种云南名贵花卉、云南中草药、国内外重要经济林木和珍稀濒危植物为主要内容，以资源植物的引种驯化和种质资源的迁地保护为主要研究方向的活植物收集园。
中国科学院西双版纳热带植物园
1959 年创建，是目前我国最大和保存物种最多的植物园。 于 1996 年从昆明植物研究所划出、与原昆明生态研究所合并成为中科院的一个独立研究机构。
中国科学院广西桂林植物研究所植物园
1935年创建，50-60年代归属中国科学院，称中国科学院广西植物研究所，并于1958年建立桂林植物园。桂林植物园地处亚热带特殊的地理位置，独特的气候孕育了丰富的植物资源。
中国科学院南京中山植物园
南京中山植物园创建于1929年，是我国第一座国立植物园。
中国科学院庐山植物园
庐山植物园创建于1934年，是我国历史最悠久的植物园，位于庐山东谷大月山和含鄱岭之间。
中国科学院沈阳应用生态研究所树木园
始建于1955年，原称沈阳植物园， 1977年更名为沈阳树木园。园内植物形成了以东北地带性树种为主体多层次的森林群落，被誉为“大城市里的小森林”。
中国科学院华南植物园鼎湖山树木园
华南植物园由陈焕镛院士等创建于1956年，2003年10月16日，经中编办批复，中国科学院华南植物研究所易名为中国科学院华南植 物园。