海伦农业生态实验站
海伦站建于1978年2月，定名为中国科学院黑龙江农业现代化研究所海伦工作站。“八五”期间，海伦站成为院中国生态系统研究网络基本站之一，1990年更名为中国科学院海伦农业生态实验站，隶属于原黑龙江农业现代化研究所，是目前国内唯一从事黑土农业生态系统长期定位监测与研究的野外台站。
沈阳生态实验站
中国科学院沈阳生态实验站建于1987年，并分别于1992年和1997年进入中国生态系统研究网络的重点站和开放站的行列。该站隶属于中国科学院沈阳应用生态研究所，位于辽宁省沈阳市苏家屯区十里河镇。
哀牢山亚热带森林生态系统研究站
1981年建站。位于哀牢山国家级自然保护区北段山顶部，在云南思茅市景东县境内，海拔2450m，隶属于中国科学院西双版纳热带植物园。哀牢山站地处西南季风气候区，属亚热带山地气候。
西双版纳热带雨林生态系统定位研究站
研究站位于云南省西双版纳傣族自治州勐腊县勐仑镇三面环水、风光旖旎的葫芦岛上（中国科学院西双版纳热带植物园内），地理位置为东经101°25′，北纬21°41′，海拔570米。植被类型为热带季节雨林、季雨林。
内蒙古草原生态系统定位研究站
实验站位于内蒙古锡林郭勒盟白音锡勒牧场境内，经纬度为43°38′E，116°42′N，海拔1187m。该区气候为温带半干旱大陆性草原气候，年均温0.2℃，夏季温凉，冬季寒冷，年均降水量350m。
海北高寒草甸生态系统定位研究站
位于N37°37'，E101°19'，地处祁连山东段北支冷龙岭南麓，大通河河谷的西北部。冷龙岭与大坂山耸立于站的南北两侧，山地平均海拔4000米，冷龙岭主峰岗什卡海拔5254.5m，常年积雪，并发育着现代冰川。
沼泽生态站
三江平原沼泽湿地生态试验站
建于1986年，隶属于中国科学院长春地理研究所，地处我国我国最大的沼泽湿地集中区－三江平原，站区（133°31′E，47°35′N）位于别拉洪河与浓江的河间地带。
鄂尔多斯沙地草地生态定位研究站
位于内蒙古鄂尔多斯高原毛乌素沙地的东北缘，隶属于中国科学院植物研究所，地理位置39°29′37.6″N，110°11′29.4″E，海拔高度：1300 a.s.l.，处于一个多层次，即包括大气环流系统、气候、地质地貌、土壤、植被与自然地带、生物区系、产业与社会文化等方面的复杂生态地理过渡带。
东湖湖泊生态系统试验站
1980年正式建站，东湖站地处长江中游（30°33′N, 114°23′E），海拔高程18米，重点研究水域之一的武汉东湖（面积27.8 km2 ，水深2-4米）是长江中下游典型的浅水湖泊。
太湖湖泊生态系统试验站
隶属于中国科学院南京地理与湖泊研究所，由本部和分部组成。无锡本部位于长江流域下游我国五大淡水湖泊梅梁湖的东岸（31°24′N，120°13′E），东太湖分部位于苏州，地处东太湖湖湾的西岸。
城市生态站
北京城市生态系统研究站
位于位于北京市海淀区双清路18号，东经115°26′，北纬39°58′。北京地貌东南部为平原，西北部为山地。气候属于暖温带半湿润气候。多年平均气温为11.7摄氏度，年平均降水585毫米。