森林生态站
哀牢山亚热带森林生态系统研究站
1981年建站。位于哀牢山国家级自然保护区北段山顶部，在云南思茅市景东县境内，海拔2450m，隶属于中国科学院西双版纳热带植物园。哀牢山站地处西南季风气候区，属亚热带山地气候。
西双版纳热带雨林生态系统定位研究站
研究站位于云南省西双版纳傣族自治州勐腊县勐仑镇三面环水、风光旖旎的葫芦岛上（中国科学院西双版纳热带植物园内），地理位置为东经101°25′，北纬21°41′，海拔570米。植被类型为热带季节雨林、季雨林。
北京森林生态系统定位研究站
成立于1990年1月，位于北京市门头沟区，距北京市区仅114 km，由中国科学院植物研究所牵头，动物研究所、生态环境研究中心联合建成，隶属于植物研究所。该地区属于太行山脉小五台山的余脉，其境内有北京市最高峰东灵山（海拔2303 m）。
长白山森林生态系统定位研究站
长白山站位于长白山北坡，长白山国家自然保护区以及吉林省安图县二道白河镇境内，东经128°28′，北纬42°24′，海拔736m。隶属于 沈阳应用生态研究所.长白山具有保存尚好的亚洲东部典型的山地森林生态系统，是欧亚大陆东北部典型的自然综合体。
鼎湖山森林生态系统定位研究站
位于广东省肇庆市鼎湖山国家级自然保护区内，地处南亚热带北缘，居北纬23°09′21″－23°11′30″，东经112°30′39″－112°33′41″，隶属于中科院华南植物园。因其丰富的生态系统多样性和典型的区域代表性而成为我国第一个自然保护区，也是我国首批加入UNESCO MAB保护区网络成员之一（第17号站）。
贡嘎山高山生态系统观测试验站
位于青藏高原东缘，其主峰海拔7556m。贡嘎山高山生态系统观测试验站(以下简称贡嘎山站)位于贡嘎山东坡海螺沟内，在成都西部360km左右, 距泸定县城约60km，主要由磨西基地站(1600m、29o39’N，102o07’E)、亚高山观测站(3000m、29o35’N，102o00’E)、)和成都分析测试中心组成。隶属于中国科学院成都山地灾害与环境研究所。
会同森林生态系统定位研究站
建站于1960年，位于湘西南的会同县广坪镇，隶属中国科学院沈阳应用生态研究所。该站位于中亚热带地区，气候温暖湿润，年平均气温16.5℃，年降水量为1200～1400mm。
茂县山地生态系统定位研究站
始建于1986年，位于四川省茂县凤仪镇，地理位置为103°53′44″E， 31°41′46″N，海拔1816米。隶属于中国科学院成都生物研究所。位于青藏高原东缘横断山系北段高山峡谷地带，长江重要支流岷江的上游中部。
